Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx5Q9D8U8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Snx5Q9D8U8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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