Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rexo2Q9D8S4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo2Q9D8S4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms