Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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