Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp2c55Q9D816 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp2c55Q9D816 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms