Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrps9Q9D7N3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrps9Q9D7N3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms