Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tube1Q9D6T1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms