Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ubxn11Q9D572 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn11Q9D572 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms