Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3404Q9D506 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm3404Q9D506 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm3404Q9D506 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3404Q9D506 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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