Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930564D02RikQ9D4S4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms