Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms