Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D454 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D454 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D454 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D454 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D454 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms