Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap53Q9D439 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms