Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms