Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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TtpalQ9D3D0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TtpalQ9D3D0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TtpalQ9D3D0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TtpalQ9D3D0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms