Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy3Q9D394 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms