Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6bQ9D289 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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