Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Mrpl28Q9D1B9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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