Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Zbed3Q9D0L1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbed3Q9D0L1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms