Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Shisa9Q9CZN4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Shisa9Q9CZN4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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