Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Nde1Q9CZA6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nde1Q9CZA6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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