Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sgo1Q9CXH7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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