Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms