Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd4Q9CWX4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd4Q9CWX4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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