Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms