Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Cnot11Q9CWN7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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