Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NubplQ9CWD8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms