Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fcf1Q9CTH6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Fcf1Q9CTH6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Fcf1Q9CTH6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fcf1Q9CTH6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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