Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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