Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9CRC3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9CRC3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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