Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nipsnap3bQ9CQE1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms