Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp2Q9CQ73 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms