Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssxb1Q9CPU1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb1Q9CPU1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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