Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms