Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2a1Q99PM3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms