Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup155Q99P88 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup155Q99P88 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms