Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntnap4Q99P47 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cntnap4Q99P47 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cntnap4Q99P47 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cntnap4Q99P47 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cntnap4Q99P47 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cntnap4Q99P47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap4Q99P47 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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