Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cep41Q99NF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cep41Q99NF3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms