Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms