Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brms1Q99N20 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms