Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf17Q99MV7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf17Q99MV7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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