Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms