Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnps1Q99M28 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms