Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gins4Q99LZ3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gins4Q99LZ3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms