Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gdpd3Q99LY2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms