Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms