Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clcc1Q99LI2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clcc1Q99LI2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clcc1Q99LI2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clcc1Q99LI2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clcc1Q99LI2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clcc1Q99LI2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms