Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ciao1Q99KN2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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