Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hps4Q99KG7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hps4Q99KG7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms