Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp11Q99K46 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp11Q99K46 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms