Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdxdc1Q99K01 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms